در این بازی راه های گوناگونی برای از بین بردن دشمنان وجود دارد و این موضوع بسته به نوع علاقۀ بازیبازان ،متفاوت است.
سلاح مأمور ۴۷ برای از بین بردن مخفیانۀ دشمنان ، یک “شریان بند” (garrote ) است. کافی است به دشمن نزدیک شده و با استفاده از آن، وی را از بین ببرید.
علاوه بر “شریان بند”، میتوان از اشیای موجود در محیط ( مجسمه، آچار ، چاقو و … ) نیز برای کشتن مخفیانه استفاده کرد.
روش دیگر از بین بردن دشمنان، همان روش سنتی، یعنی استفاده از سلاح گرم است.